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El archipiélago cubano se localiza en uno de los 35 puntos calientes de diversidad (biodiversity hotspots) del planeta. El Caribe insular contiene una de las biotas más amenazadas debido a la alta densidad de población humana y otras presiones socioeconómicas. Dentro de la región, Cuba, es la isla de mayor extensión y la más cercana al continente. Cuba es un archipiélago tropical formado por la isla de Cuba con 104 556 km2, la Isla de la Juventud, de 2204 km2, y alrededor de 4195 cayos e islotes adyacentes agrupados en cuatro archipiélagos: Los Colorados, Sabana-Camagüey, Canarreos y Jardines de la Reina, totalizando un área de 3 126 km2. También incluye una plataforma submarina de 67 831 km2 , lo que arroja una superficie total de 178 753 km2.
El relieve es mayoritariamente llano, en más del 80 % del área y el resto son zonas de alturas moderadas y montañas. Los cuatro grupos montañosos más importantes son: Guaniguanico, Guamuhaya, Nipe-SaguaBaracoa y la Sierra Maestra. En la Sierra Maestra, el Pico Turquino y el Pico Cuba, con 1974 y 1874 m s. n. m., son las elevaciones más altas del archipiélago cubano, respectivamente. Más del 66 % de la superficie terrestre está formada por rocas karstificadas y existe una alta densidad de cuevas y cavernas. Por la forma larga y estrecha de la isla, los ríos en Cuba no son grandes y tienen un recorrido corto, desde el centro de la isla hacia la costa norte o sur. Se presentan 573 cuencas hidrográficas, la mayoría represadas y los ríos de mayor extensión son el Cauto, Zaza, Sagua la Grande, Caonao y el Toa. En general, el clima es tropical moderado y mantiene un marcado ciclo estacional de precipitaciones, con influencia temporal de masas continentales de aire frío. La temporada de lluvias se extiende de mayo a octubre y la temporada menos lluviosa, seca en algunas zonas, de noviembre a abril. El régimen de precipitaciones alcanza una media de 1375 mm anuales, pero su distribución espacial no es homogénea. Las temperaturas son generalmente altas y los valores promedios anuales oscilan de 22 a 28°C, aunque varían según la región y la elevación.
Cuba, como archipiélago, es de origen relativamente antiguo con estructura geológica y biogeografía complejas, ya que se encuentra en la unión de dos bloques tectónicos. La región occidental y central pertenece a la placa norteamericana, la cual continúa con las Bahamas y Florida. La región oriental es parte de la placa del Caribe, un sistema de valles sumergidos y cordilleras que emergen en Cozumel y Yucatán. Pero la Sierra Maestra y toda la porción sureste es parte del Caimán Dorsal, a través de cuya base se establece un vínculo geológico con el norte de Centroamérica. La complejidad de los procesos de origen del archipiélago cubano, su condición de insularidad, la relativa estabilidad de algunas de sus regiones, el clima, la alta variedad geológica de los suelos, y la ubicación tropical e intercontinental han actuado en sinergia con el proceso evolutivo de la vida para dar lugar a la biota cubana.
El Grupo de Especialistas en Plantas Cubanas (UICN/CSE) tiene nodo central en Planta! – Plantlife Conservation Society y en el Jardín Botánico Nacional de la Universidad de La Habana.
